Os fabricantes tendem a enfrentar certos desafios ao implementar uma solução de engenharia de sistemas industriais, como a complexidade da integração de vários sistemas, a necessidade de conhecimento especializado, os altos custos iniciais e a resistência à alteração dos fluxos de trabalho existentes. Superar esses desafios requer uma abordagem bem planejada e em fases, forte apoio da liderança e estratégias eficazes de gerenciamento de mudanças.
No entanto, o período de transição necessário para superar esses desafios comuns vale os benefícios significativos da implementação de uma solução de simulação de sistemas industriais. Audi Hungria alcançou valor agregado de engenharia ao mudar de modelos 2D para 3D para simulação de fabricação, juntamente com três benefícios principais: aumento no valor do modelo, aprovação e aceitação mais rápidas do projeto e aumento significativo do desempenho.