Os fabricantes tendem a enfrentar certos desafios ao implementar uma solução de engenharia de sistemas industriais, tais como a complexidade da integração de vários sistemas, a necessidade de conhecimentos especializados, elevados custos iniciais e a resistência a alterar os fluxos de trabalho existentes. Superar estes desafios requer uma abordagem bem planeada e faseada, um forte apoio da liderança e estratégias eficazes de gestão da mudança.
No entanto, o período de transição necessário para ultrapassar estes desafios comuns vale os benefícios significativos da implementação de uma solução de simulação de sistemas industriais. Audi Hungria alcançou valor acrescentado de engenharia ao mudar de modelos 2D para 3D para simulação de fabrico, juntamente com três benefícios principais: um aumento no valor do modelo, aprovação e aceitação mais rápidas do projeto e um aumento significativo no desempenho.